【求助】大片段DNA(6.4K)与载体连接所需的载体,反转录酶,PCR聚合酶的选择!!!
2021-08-05
问题描述:
各位大侠:小弟最近做个长片段的CDNA与T载体的连接,片段大小6.4K,载体选用的是pUC19和pGEMT-easy,反转录酶用的是RevertAidTirstStrandcDNASynthesisKit(#K1621),CDNA第二链的扩增用的是LATaq。我是用纯病毒的RNA做模板,操作步骤严格按照说明做的,也曾经有一次获得过电泳图清晰显示的是全长6.4KB左右的片段,与载体连接,结果筛选到的几个克隆,插入的片段仅有2KB左右,奈何?可最近几次再用此反转录试剂盒却不能得到所需片段。在此,小弟想问问大家,你们是否遇到同样的问题,是如何解决的?所用的试剂(载体和酶的选择)和方法是什么,可以告诉后来者,共同进步吧。
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已过了一周了,大侠还没有出现,期待中...............
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我想主要是你的片段比较大,虽然如你所言,能够通过RT-PCR得到你要的片段。但筛选到的克隆通常仅有2kB左右。我认为这很可能是质粒的稳定性问题。我记得看过Epicentre公司和Lucigen公司的一些实验tipsandtroubleshooting之类的资料。这些公司的专家声称有一些DNA片段就是特别难以克隆,他们常常采用的措施是降低克隆质粒的拷贝数,使用transcription-free的质粒,比如lucigen公司就有这类质粒。当然,我没有用过这两家公司的任何产品,只是经常到他们的网页浏览,看看有什么新东西。我目前常用的克隆载体是Fermentas公司的CloneJET试剂盒,克隆3kB的片段的效率都很高,远远优于Takara公司的pMD18T-simple。以上意见仅供参考
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